Perpustakaan Pusat memiliki dan mengembangkan 2 (dua) repositori, yaitu repository dan e-theses, serta 1 (satu) e-resources.
Repository memuat karya ilmiah dosen dan tenaga kependidikan, situsnya dapat diakses melalui http://repository.uin-malang.ac.id/.
Sedangkan e-theses menyimpan karya tugas akhir mahasiswa dan beralamat di http://etheses.uin-malang.ac.id/
Koleksi digital yang ketiga adalah e-resources yang menyebarkan buku-buku elektronik berlisensi terbuka. Saat ini, e-resources Perpustakaan Pusat bisa diakses dengan menggunakan jaringan WiFi kampus di http://eresources.uin-malang.ac.id/s/eres/page/home